DOCK5は骨肉腫で発現が低下している

PMID: 19286668

Identification of interactive networks of gene expression associated with osteosarcoma oncogenesis by integrated molecular profiling.
Sadikovic B, Yoshimoto M, Chilton-MacNeill S, Thorner P, Squire JA, Zielenska M.
Hum Mol Genet. 2009 Jun 1;18(11):1962-75.

PMID:18698372で開発された、「an integrative approach for genome-wide high-resolution profiling of genetic, epigenetic and gene expression changes」を用いて、ヒト手術材料からゲノミックDNAやマイクロアレイを用いて発現を全部調べた論文。10例中5例で、DOCK5とTNFRSF10A/Dの染色体上の場所である8p21.2-p21.3が欠失し、アレイでは発現が下がっているという結果を得ている。

これが、
PMID: 20465837
Expression analysis of genes associated with human osteosarcoma tumors shows correlation of RUNX2 overexpression with poor response to chemotherapy.
Sadikovic B, Thorner P, Chilton-Macneill S, Martin JW, Cervigne NK, Squire J, Zielenska M.
BMC Cancer. 2010 May 13;10:202
治療に反応せず予後が悪い骨肉腫臨床サンプル(Huvos grade)での検証につながる。発現の大体の傾向は以前の論文と同じだが、TNFRSF10A/Dは有意ではなかった。治療とはこの場合、cisplatin, doxorubicin, methotrexate。
予後との相関があったものは、RUNX2(骨肉腫で上昇)のみ。
ホルマリンサンプルからもRNA取れるんだ。